Su primera fundación fue el 23 de agosto de 1870 y la segunda y definitiva el 12 de agosto de 1910
El primer local donde funcionó la escuela primaria, fue un predio que había sido donado por el filántropo señor Luzárraga, frente a la plaza de la Catedral (hoy parque Seminario), en la manzana comprendida por las calles de la Caridad (hoy Chile), de San Vicente o de la Aduana (hoy Clemente Ballén), del Teatro (hoy 10 de Agosto). La casa era estrecha pero de buena presentación, gracias a los arreglos asumidos por el gobierno y los realizados con fondos municipales.
El Campus norte o mirador La Salle como se le conocía, está ubicado en la Cdla. Pájaro Azul en la Av. Felipe Pezo Campuzano y fue adquirido por el Hno. Eusebio Araya Caballero en el año 1975 cuando ejercía como rector, con el fin de que, en un futuro, se construya allí el nuevo Colegio San José La Salle.
A lo largo de estos años se ha ido construyendo paso a paso las nuevas Instalaciones de la Unidad Educativa.
En el año 1985 en la rectoría del Hno. Pablo Armijos Ordóñez, se construyó el complejo La Salle. Para el año 2004, siendo rector el Hno. Luis Lazo Álvarez, se edificó el bloque de aulas del pre-escolar.
Ya para el año 2009 el Hno. rector, Richard Manosalvas, construye el bloque de aulas de la Básica Elemental y Media. La primaria se traslada desde el Campus Centro a estas nueva edificación en el Campus Norte.
Para el año 2017 se termina el complejo deportivo con la construcción del Estadio La Salle, con el apoyo de los Hermanos Ricardo Orellana y Richard Manosalvas; coordinador del Sector Ecuador y Ecónomo del mismo, respectivamente. En el año 2019 se construyen las aulas para básica superior. En marzo del 2021 se inauguró el nuevo auditorio con capacidad para 750 personas. Además, en el año 2022 se inicia la construcción de las aulas de bachillerato y en el año 2023 funciona toda la institución en este nuevo campus.
Av. Felipe Pezo Campuzano y Guillermo Cubillo, Cdla. Pájaro Azul (diagonal a Jardines de Esperanza)
3919100 - 3919101
Secretaría Inicial 4231
Secretaría Básica Elemental y Media 4233
Secretaría Básica Superior y Bachillerato 4232